Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.18
HDAC1Q13547 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
HDAC1Q13547 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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