Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-2.26□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-2.28□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
POLR1AO95602 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.32□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
POLR1AO95602 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
POLR1AO95602 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
POLR1AO95602 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
POLR1AO95602 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
POLR1AO95602 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
POLR1AO95602 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
POLR1AO95602 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
POLR1AO95602 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
POLR1AO95602 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
POLR1AO95602 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
POLR1AO95602 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
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