Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.07□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
CLDN3O15551 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
CLDN3O15551 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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