Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.81□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Q6P435 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Q6P435 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Q6P435 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Q6P435 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Q6P435 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
Q6P435 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
Q6P435 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-14-201ENST00000363090 81 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-16-201ENST00000363887 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.79□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
Q6P435 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
Q6P435 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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