Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-11-201ENST00000363616 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-5-201ENST00000363633 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-39-201ENST00000363694 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-4-201ENST00000363810 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-6-201ENST00000363942 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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ECM1Q16610 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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ECM1Q16610 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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ECM1Q16610 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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ECM1Q16610 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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ECM1Q16610 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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ECM1Q16610 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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ECM1Q16610 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ECM1Q16610 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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ECM1Q16610 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
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ECM1Q16610 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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ECM1Q16610 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
ECM1Q16610 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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ECM1Q16610 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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