Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 MIR342-201ENST00000362212 99 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CNN3Q15417 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CNN3Q15417 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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