Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
DUSP4Q13115 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
DUSP4Q13115 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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