Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
GRIK3Q13003 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
GRIK3Q13003 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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