Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PTPRAP18433 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
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PTPRAP18433 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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PTPRAP18433 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
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PTPRAP18433 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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PTPRAP18433 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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PTPRAP18433 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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PTPRAP18433 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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PTPRAP18433 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPRAP18433 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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