Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.26□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.25□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
C15orf40Q8WUR7 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms