Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SKIDA1Q1XH10 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-34-201ENST00000362441 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SKIDA1Q1XH10 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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