Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ZNF239Q16600 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
ZNF239Q16600 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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