Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SCN9AQ15858 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.25□□□□□ -2.45
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SCN9AQ15858 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
SCN9AQ15858 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
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