Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SCN5AQ14524 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SCN5AQ14524 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms