Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 SNORA26.2-201ENST00000390922 122 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
FHL3Q13643 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.76□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
FHL3Q13643 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.1 ms