Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SQSTM1Q13501 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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