Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
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TOP1MTQ969P6 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TOP1MTQ969P6 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
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TOP1MTQ969P6 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TOP1MTQ969P6 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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TOP1MTQ969P6 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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TOP1MTQ969P6 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TOP1MTQ969P6 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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TOP1MTQ969P6 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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TOP1MTQ969P6 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TOP1MTQ969P6 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TOP1MTQ969P6 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TOP1MTQ969P6 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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TOP1MTQ969P6 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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TOP1MTQ969P6 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TOP1MTQ969P6 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
TOP1MTQ969P6 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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