Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

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Length 738 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.43□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.34
ZNF235Q14590 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.4□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
ZNF235Q14590 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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