Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
IRF5Q13568 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
IRF5Q13568 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200 ms