Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNORD115-15-201ENST00000364809 81 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-26-201ENST00000365067 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-10-201ENST00000365073 81 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-43-201ENST00000365503 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-36-201ENST00000365629 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATRQ13535 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATRQ13535 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATRQ13535 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATRQ13535 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATRQ13535 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.55
ATRQ13535 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-0.92□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RPS29P24-201ENST00000486345 171 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
ATRQ13535 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
ATRQ13535 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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