Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SQSTM1Q13501 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SQSTM1Q13501 SNORD115-12-201ENST00000362583 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 SNORD115-29-201ENST00000362834 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 SNORD115-9-201ENST00000362912 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 SNORD115-21-201ENST00000362963 81 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SQSTM1Q13501 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SQSTM1Q13501 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SQSTM1Q13501 SNORD115-1-201ENST00000364961 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SQSTM1Q13501 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SQSTM1Q13501 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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SQSTM1Q13501 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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SQSTM1Q13501 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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SQSTM1Q13501 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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SQSTM1Q13501 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SQSTM1Q13501 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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