Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SNTA1Q13424 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SNTA1Q13424 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
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