Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
TRAF3Q13114 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TRAF3Q13114 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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