Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GRIK3Q13003 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.39□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIK3Q13003 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 356.1 ms