Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PTP4A2Q12974 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PTP4A2Q12974 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 270 ms