Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
CNN3Q15417 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CNN3Q15417 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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