Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
PTPRRQ15256 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
PTPRRQ15256 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.9 ms