Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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COL9A2Q14055 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 MIR548A2-201ENST00000384956 97 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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COL9A2Q14055 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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COL9A2Q14055 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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COL9A2Q14055 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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COL9A2Q14055 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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COL9A2Q14055 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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COL9A2Q14055 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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COL9A2Q14055 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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COL9A2Q14055 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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COL9A2Q14055 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
COL9A2Q14055 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
COL9A2Q14055 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
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