Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 Y_RNA.286-201ENST00000364813 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
PTPRTO14522 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 MIR4423-201ENST00000580922 80 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PTPRTO14522 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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