Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TRIM63Q969Q1 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.494-201ENST00000384432 111 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
TRIM63Q969Q1 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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