Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
SGCBQ16585 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
SGCBQ16585 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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