Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
COL9A2Q14055 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A2Q14055 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A2Q14055 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A2Q14055 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A2Q14055 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A2Q14055 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
COL9A2Q14055 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
COL9A2Q14055 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
COL9A2Q14055 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A2Q14055 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A2Q14055 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A2Q14055 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A2Q14055 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A2Q14055 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A2Q14055 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.54□□□□□ -2
COL9A2Q14055 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
COL9A2Q14055 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A2Q14055 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A2Q14055 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A2Q14055 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A2Q14055 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A2Q14055 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A2Q14055 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A2Q14055 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC2.53□□□□□ -2
COL9A2Q14055 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
COL9A2Q14055 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
COL9A2Q14055 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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