Protein–RNA interactions for Protein: Q13501

SQSTM1, Sequestosome-1, humanhuman

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQSTM1Q13501 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SQSTM1Q13501 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SQSTM1Q13501 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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