Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGB1Q14028 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGB1Q14028 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGB1Q14028 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGB1Q14028 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CNGB1Q14028 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CNGB1Q14028 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CNGB1Q14028 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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