Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
ATRQ13535 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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ATRQ13535 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ATRQ13535 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
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