Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
PDE3BQ13370 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
PDE3BQ13370 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
PDE3BQ13370 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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