Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
PTPRTO14522 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRTO14522 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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