Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHOC2Q9UQ13 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHOC2Q9UQ13 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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