Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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USP49Q70CQ1 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
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USP49Q70CQ1 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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USP49Q70CQ1 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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USP49Q70CQ1 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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USP49Q70CQ1 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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USP49Q70CQ1 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
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USP49Q70CQ1 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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USP49Q70CQ1 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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USP49Q70CQ1 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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USP49Q70CQ1 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP49Q70CQ1 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP49Q70CQ1 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
USP49Q70CQ1 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
USP49Q70CQ1 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP49Q70CQ1 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP49Q70CQ1 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP49Q70CQ1 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP49Q70CQ1 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP49Q70CQ1 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
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USP49Q70CQ1 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
USP49Q70CQ1 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2□□□□□ -2.09
USP49Q70CQ1 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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