Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.55□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SKIDA1Q1XH10 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SKIDA1Q1XH10 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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