Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AL359075.3-201ENST00000613288 217 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
TNFAIP1Q13829 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.8 ms