Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPN13Q12923 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 SNORD115-42-201ENST00000364273 82 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPN13Q12923 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
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