Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AL138889.2-201ENST00000603883 242 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC011373.1-201ENST00000607270 237 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
CENPEQ02224 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC-1.97□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
CENPEQ02224 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.2 ms