Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sdr16c6Q05A13 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms