Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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SNX17Q15036 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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SNX17Q15036 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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SNX17Q15036 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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SNX17Q15036 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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SNX17Q15036 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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SNX17Q15036 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SNX17Q15036 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SNX17Q15036 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
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SNX17Q15036 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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SNX17Q15036 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
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SNX17Q15036 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
SNX17Q15036 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SNX17Q15036 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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SNX17Q15036 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
SNX17Q15036 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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