Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SSPNQ14714 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SSPNQ14714 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 251 ms