Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
RAB33AQ14088 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
RAB33AQ14088 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.57□□□□□ -2
RAB33AQ14088 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AC109810.1-201ENST00000534066 224 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.56□□□□□ -2
RAB33AQ14088 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB33AQ14088 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB33AQ14088 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB33AQ14088 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB33AQ14088 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB33AQ14088 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB33AQ14088 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
RAB33AQ14088 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
RAB33AQ14088 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.53□□□□□ -2
RAB33AQ14088 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1172 ms