Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A2Q14055 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A2Q14055 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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