Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.43□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC0.42□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
DDX39BQ13838 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.4□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
DDX39BQ13838 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
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