Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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TRAF3Q13114 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRAF3Q13114 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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TRAF3Q13114 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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TRAF3Q13114 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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TRAF3Q13114 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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TRAF3Q13114 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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TRAF3Q13114 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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TRAF3Q13114 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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TRAF3Q13114 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
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TRAF3Q13114 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TRAF3Q13114 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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